Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxg1Q60987 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxg1Q60987 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms