Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf3Q60980 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms