Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
JrkQ60976 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JrkQ60976 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JrkQ60976 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JrkQ60976 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
JrkQ60976 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JrkQ60976 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms