Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp7Q60973 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms