Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac1Q60932 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac1Q60932 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vdac1Q60932 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vdac1Q60932 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms