Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms