Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a4Q60857 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc6a4Q60857 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms