Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mkrn3Q60764 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms