Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms