Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SkiQ60698 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SkiQ60698 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SkiQ60698 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SkiQ60698 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms