Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd4Q60688 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms