Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PtprnQ60673 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprnQ60673 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprnQ60673 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprnQ60673 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprnQ60673 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprnQ60673 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PtprnQ60673 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprnQ60673 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprnQ60673 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprnQ60673 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprnQ60673 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PtprnQ60673 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PtprnQ60673 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PtprnQ60673 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprnQ60673 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PtprnQ60673 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PtprnQ60673 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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