Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik1Q60670 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sik1Q60670 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms