Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScinQ60604 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ScinQ60604 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScinQ60604 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScinQ60604 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScinQ60604 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScinQ60604 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScinQ60604 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms