Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CttnQ60598 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CttnQ60598 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CttnQ60598 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms