Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uimc1Q5U5Q9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms