Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gprasp1Q5U4C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Gprasp1Q5U4C1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gprasp1Q5U4C1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gprasp1Q5U4C1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gprasp1Q5U4C1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms