Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd3Q5U419 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd3Q5U419 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd3Q5U419 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms