Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1Q5SXY1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1Q5SXY1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms