Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc42Q5SV66 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms