Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctc1Q5SUQ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms