Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms