Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefmQ5SSK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms