Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav6-2Q5R1I4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav6-2Q5R1I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms