Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps41Q5KU39 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms