Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SynaQ5G5D5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms