Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrc3Q5DU56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrc3Q5DU56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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