Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam208bQ5DTT3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam208bQ5DTT3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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