Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f8Q58FA4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f8Q58FA4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f8Q58FA4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f8Q58FA4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f8Q58FA4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f8Q58FA4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f8Q58FA4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms