Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnl1Q52KE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnl1Q52KE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms