Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2L5

Gm904, Gene model 904, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm904Q3V2L5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm904Q3V2L5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm904Q3V2L5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm904Q3V2L5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms