Protein–RNA interactions for Protein: Q3V172

Sel1l2, Protein sel-1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l2Q3V172 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sel1l2Q3V172 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sel1l2Q3V172 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sel1l2Q3V172 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms