Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc43Q3V0L5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc43Q3V0L5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms