Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncbp1Q3UYV9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncbp1Q3UYV9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms