Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms