Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l2Q3UXB0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms