Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc114Q3UX62 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc114Q3UX62 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms