Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330034G19RikQ3UWX6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330034G19RikQ3UWX6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms