Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScimpQ3UU41 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms