Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Drc1Q3USS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Drc1Q3USS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Drc1Q3USS3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms