Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fchsd2Q3USJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fchsd2Q3USJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fchsd2Q3USJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms