Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28047Q3US59 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms