Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm20Q3UQS8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm20Q3UQS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm20Q3UQS8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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