Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mindy4Q3UQI9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms