Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp953Q3UPV7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp953Q3UPV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp953Q3UPV7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms