Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms