Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q3UPC7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UPC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UPC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UPC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q3UPC7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q3UPC7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms