Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2l1Q3UNW5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2l1Q3UNW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms