Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330014E10RikQ3UL33 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms