Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ceacam5Q3UKK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam5Q3UKK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ceacam5Q3UKK2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms